返回 MCP 目录
public公开dns本地运行

NexOnco (CIViC Precision Oncology)

Nexonco是由Nexgene Research开发的MCP服务器,用于快速查询CIViC数据库中的临床证据,支持精准肿瘤学研究。

article

README

🚀 Nexonco 临床证据查询工具

Nexonco 由 Nexgene 研究提供,是一个基于 MCP 协议的服务器。它能从 CIViC(临床变体在癌症中的医学解释)数据库中访问临床证据,支持快速、灵活地搜索变异、疾病、药物和表型信息,助力精准肿瘤学研究。

nexonco-mcp-banner

[![PyPI](https://img.shields.io/badge/PyPI-nexonco--mcp-000000.svg?style=for-the-badge&logo=pypi&labelColor=000)](https://pypi.org/project/nexonco-mcp) [![NANDA](https://img.shields.io/badge/NANDA-Nexonco-000000.svg?style=for-the-badge&logo=&labelColor=000)](https://ui.nanda-registry.com/servers/c6284608-6bce-4417-a170-da6c1a117616) [![License](https://img.shields.io/badge/License-MIT-000000.svg?style=for-the-badge&logo=github&labelColor=000)](https://github.com/Nexgene-Research/nexonco-mcp/blob/main/LICENSE)

🚀 快速开始

演示

https://github.com/user-attachments/assets/02129685-5ba5-4b90-89e7-9d4a39986210

观看完整视频:此处

安装与配置

依赖项

Python >= 3.6
Jupyter Notebook
requests
pandas

配置步骤

  1. 克隆仓库:
    git clone https://github.com/Nexgene-Research/nexonco-mcp.git
    cd nexonco-mcp
    
  2. 安装依赖项:
    pip install -r requirements.txt
    
  3. 启动服务器:
    python server.py
    

✨ 主要特性

核心功能

  • 实时数据查询:通过 CIViC 数据库获取最新的临床证据。
  • 多条件搜索:支持对变异、疾病、药物和表型的组合查询。
  • 结果可视化:以表格和图表形式展示查询结果,便于分析。

示例用例

# 查询特定药物的疗效
results = query_therapies("Imatinib", "leukemia")
print(results)

📚 详细文档

使用说明

输入格式

{
  "query": {
    "therapy": "Imatinib",
    "disease": "leukemia"
  },
  "options": {
    "include": ["evidence_level", "clinical_significance"]
  }
}

输出格式

[
  {
    "therapy": "Imatinib",
    "disease": "leukemia",
    "evidence_level": "Level 1",
    "clinical_significance": "Effective"
  },
  ...
]

示例查询

查询示例

  • 问题:哪些疗法与胰腺癌证据相关?
  • 查询代码
    results = query_therapies(disease="pancreatic cancer")
    print(results)
    

📄 许可证

本项目采用 MIT 许可证,具体条款请参见 LICENSE 文件。

⚠️ 重要提示

本工具仅供研究用途。它不能替代专业医疗建议、诊断或治疗。

👥 贡献者

help

运行方式说明

cloud

托管运行

托管运行通常表示这个 MCP Server 由服务方环境承载,用户一般按页面提供的连接方式或授权流程接入,不需要在本地长期启动一个 MCP 进程

  1. 打开服务方连接页
  2. 完成授权或复制端点
  3. 在 MCP 客户端中连接
terminal

本地运行 / 其它方式

本地运行通常需要用户在自己的电脑或服务器上安装依赖,把 server_config 复制到 MCP 客户端,并按 env_schema 补齐环境变量、密钥或其它配置

  1. 复制 server_config
  2. 安装所需依赖
  3. 补齐环境变量后重启客户端